En els xifratges per transposició, les lletres del missatge simplement estan reordenades, de manera que s'ha generat un anagrama de forma eficient.

Perquè la transposició sigui efectiva, la reordenació de les lletres ha de seguir un sistema acordat prèviament per l'emissor i el receptor del missatge, però que es manté secret per a la resta de la gent. En aquesta secció estudiarem dos tipus de transposició: el Rail Fence i el quadrat llatí.

El xifratge Rail Fence xifra els missatges escrivint les lletres dels missatges en dues línies alternades. La seqüència de lletres a la línia superior a continuació va seguida per una seqüència a la línia inferior per crear el missatge xifrat. Pots veure com funciona el Rail Fence anant a la pàgina següent.