La potència del xifratge de Vigenère és deguda al fet que la mateixa lletra es pot xifrar de maneres diferents. Per exemple, si la paraula clau és KING (rei), llavors cada lletra del text net pot xifrar-se de quatre maneres, ja que la paraula clau conté 4 lletres. Cada lletra de la paraula clau defineix un alfabet de xifratge diferent en el quadrat de Vigenère. La columna E s'ha destacat pel fet de demostrar que el xifratge depèn de quina lletra de la paraula clau està definint el xifratge. De la mateixa manera, paraules completes es xifraran de diferents maneres -l'article the (el) es pot xifrar com a DPR, BUK, GNO and ZRM, segons la posició relativa a la paraula clau. Encara que això dificulta la criptoanàlisi, no la fa impossible. S'ha de destacar que, si només hi ha quatre maneres de xifrar la paraula the i el text original conté diverses vegades aquesta paraula, és inevitable que algun dels quatre possibles xifratges es repeteixi en el criptograma. Això es demostra en l'exemple següent, en el qual el text The sun and the man on the moon (El sol i l'home a la lluna) s'ha xifrat amb el mètode de Vigenère, usant la clau KING.

En aquest exemple, la paraula the s'ha xifrat com DPR la primera vegada, i com BUK la segona i tercera vegades. La raó de la repetició de BUK és el fet que el segon the està desplaçat 8 posicions respecte del tercer, i 8 és un múltiple de la longitud de la paraula clau. En altres paraules, quan hem de xifrar el segon the, la paraula clau s'ha repetit exactament dues vegades i la posició respecte a la paraula clau torna a ser la inicial.